「Jupyterで始めるシングルセルRNA-seq解析環境構築」勉強会

 　アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。 初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は、「Jupyterで始めるシングルセルRNA-seq解析環境構築」をテーマに開催いたします。

 近年、シングルセルRNA解析は多くの研究で行われており、さまざまな解析ソフトウェアが公開されていますが、「論文のmethodsを参考に研究をすすめるためのバイオインフォマティクス環境」を整備するハードルは高いのが現状です。
　本セミナーでは、まず、シングルセルRNAデータ解析の手法や解析プロトコルを紹介し、公開データとSeuratを用いた基本的なデータ解析について、クラスタリングや細胞種の同定を中心に解説します。
　データ解析をするための、解析環境構築について、PC選定やソフトウェアのインストール、Jupyterで作成したノートブック上での実行から、プロトコルの記録まで、ご説明いたします。
　シングルセルRNA-seqの公開データで試したい、データ解析環境の構築に不安があるといったお悩みを解消します。