「PSILO」は、SBDD（Structure Based Drug Design）で利用されるタンパク質立体構造データや複合体に関連する情報をデータベース化し、ウェブブラウザーにより 参照・解析できるシステムです。
PDBの公共データと自社で構造解析された複合体データを共通のデータベースで管理することができ、構造生物学者や計算化学者、実験研究者など様々な立場の研究者がタンパク質立体構造に関連する情報を共有することができます。PSILOでは、タンパク質立体構造データに関して次のような検索、アノテーション情報の参照、解析を行うことが出来ます。
PDBの公共データと自社で構造解析された複合体データを共通のデータベースで管理することができ、構造生物学者や計算化学者、実験研究者など様々な立場の研究者がタンパク質立体構造に関連する情報を共有することができます。PSILOでは、タンパク質立体構造データに関して次のような検索、アノテーション情報の参照、解析を行うことが出来ます。
検索
- タンパク質-リガンド相互作用
- 類似タンパク質ポケット
- キーワード、配列アノテーション
- リガンドの部分構造、類似構造
- タンパク質アミノ酸配列、抗体アミノ酸配列
タンパク質
- 立体構造の表示と相互作用部位における重ね合わせ
- 電子密度マップと座標データの重ね合わせ
- タンパク質立体構造の妥当性のチェック
- 活性部位／相補性決定領域（抗体）の残基
- 相同配列
- SCOPファミリーデータ
- Gene OntologyやInterProの各種アノテーション
リガンド
- 相互作用部位の2D図
- SMILES表記、InChi表記
- 結合次数の修正
本セミナーでは、PSILOの検索、参照、解析などの各機能をご説明するとともに、PSILOのデモンストレーションを行います。
皆様のご参加をお待ちいたしております。
申込み締め切り：開催日５日前まで
プログラム
- PSILOの概要
- データ検索・参照・解析の各機能の紹介
- 自社データの登録
- ユーザ管理機能
参加費
無料
定員
なし
主催
株式会社モルシス
お問い合わせ先
◇お問い合わせフォーム
https://molsis.powerappsportals.com/ja-JP/Contact/
