AI創薬 × 実験自動化
AI×実験自動化の潮流①
Orbis Medicinesが示す「Lab-in-the-Loop」創薬の可能性
AI創薬は、「AIが有望な化合物を設計・提案する」という枠組みを超えて次のステージへと進んでいます。近年注目を集めているのが、分子設計・合成・評価・学習を一つの閉ループに統合する「Lab-in-the-Loop」という研究アプローチです。AIが設計した仮説を自動化実験によって迅速に検証し、その結果を再びAIにフィードバックすることで創薬サイクルを加速させる試みが進んでいます。
本稿では、その最前線を走るデンマーク発の創薬スタートアップ Orbis Medicines の取り組みを起点に、AIと実験自動化の融合がもたらす創薬研究の変革と、それが日本の研究現場にとってどのような意味を持つのかを解説します。
01
AI創薬の新たな潮流:分業から「閉ループ」へ
これまでのAI創薬は、AIが候補化合物を提案し、人間が実験でそれを検証するという分業型のアプローチが主流でした。しかし今、業界の関心はさらに一歩先へと進んでいます。
分子設計だけでなく、実験の実行・評価・学習までを一つの閉ループとして統合する。これが「AI×実験自動化(Lab-in-the-Loop)」と呼ばれる、次世代創薬の中核概念です。
AIが仮説を生成し、自動化された実験設備がそれを検証し、得られた結果を再びAIが学習する。このサイクルを高速で回すことで、従来の創薬プロセスでは到達できなかった探索効率が実現されようとしています。
Lab-in-the-Loop の基本サイクル
① AIが分子を設計 ② 自動設備が合成・評価 ③ データをAIが学習 ④ 次の分子を設計
この考え方を実装し、実際に成果を挙げつつある企業の1つが創薬スタートアップ Orbis Medicines です。
02
Orbis Medicinesが挑む AI×自動実験プラットフォームによる「経口マクロサイクル」の創出
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バイオ医薬品(抗体医薬など)は高い治療効果を持つ一方、その多くは注射剤としてしか投与できません。患者にとってはより服用しやすい経口薬へのニーズが根強く、創薬業界では長年にわたり次のような課題が議論されてきました。
「注射剤並みの効果を持ちながら、飲み薬として投与できる医薬品」をいかに実現するか。
Orbis Medicines は、この難題に対して独自の「nCycles」と呼ばれる完全合成のマクロサイクル化合物群を、自社プラットフォーム「nGen」によって設計・創出しています。
POINT
nCycles は経口吸収性と膜透過性を最適化するよう設計されており、これまで注射でしか投与できなかった標的にも、経口薬でアプローチできる可能性を切り拓く分子群です。
マクロサイクルは、低分子医薬と抗体医薬の中間に位置するモダリティとして期待されている一方、その化学空間は膨大で、従来の研究手法では十分な探索が困難でした。そこで Orbis Medicines は、AIと実験自動化を融合させた研究開発体制を構築することで、この巨大な化学空間の探索に本格的に挑んでいます。
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AI×自動実験を中核とした創薬プラットフォーム「nGen」
Orbis Medicines の特徴は、AIによる分子設計にとどまらず、実験そのものを大規模に自動化している点にあります。nGen プラットフォームは、以下の要素を一体化した仕組みで構成されています。
- ハイスループットな自動合成:人手を介さない大規模並列合成
- 大規模スクリーニングとアッセイ:迅速かつ標準化された評価
- 自動データ取得:実験結果をリアルタイムでデジタル化
- AIによる解析と次候補の設計:データから次の一手を自動導出
同社は数十万規模の類縁体を高速に合成・評価するプロセスを回しています。さらに、AIスーパーコンピュータ「Gefion」の活用によって、この探索・学習サイクルをさらに加速させる取り組みも進めています。
この一体化されたプロセスは「Lab-in-the-Loop」と呼ばれ、AIと実験基盤の融合こそが自分たちの競争力の源泉であると明確に位置づけています。
04
なぜ創薬研究に「自動合成」が不可欠なのか
AI創薬というと、大規模言語モデルや生成AIによる分子設計の話題が先行しがちです。しかし実際の創薬サイクルは、次の三つのステップから成り立っています。
- AIが候補化合物を設計する
- 実験でその性質を検証する
- 得られた結果をAIが学習し、次の設計に活かす
このサイクルの中で、最もボトルネックになりやすいのが2番目の「実験」です。どれほど優れたAIが分子を提案しても、それを合成し検証する速度が追いつかなければ、学習に使えるデータは増えていきません。
特に中分子のような複雑な化合物群では、候補となる構造の数が膨大になるため、人手による合成・評価では到底スケールが追いつかないのが実情です。
| 従来型創薬 | Lab-in-the-Loop型 | |
|---|---|---|
| 実験主体 | 人手中心 | 自動合成・自動評価 |
| 1サイクルの速度 | 週~月単位 | 日~時間単位 |
| 取得データ量 | 限定的 | 桁違いに大量 |
| AIとの連携 | 限定的(オフライン) | 継続学習ループを形成 |
| 属人性 | 高い | 低い(標準化) |
近年のAI創薬では、「どれだけ優れたAIを持っているか」だけでなく、どれだけ高速かつ大量に実験を回せるかが競争優位を左右する要素になりつつあります。Orbis Medicines の事例が示しているのは、AI単体ではなく、AIと自動合成・自動評価の基盤を一体化させたプラットフォームこそが、次世代創薬の本質であるということです。
05
自動合成がもたらすもう一つの価値:属人化からの解放
実験自動化の価値は、スピード向上だけにとどまりません。特に重要なのが、研究現場に根強く残る属人化の解消です。
多くの研究機関や企業では、次のような課題を抱えています。
研究現場が抱える属人化の課題
- 熟練した研究者でなければ再現できない実験手技
- 個人の経験や勘に依存した条件最適化
- 実験者ごとのばらつきによるデータ品質の低下
- 退職や異動によって失われるノウハウ
こうした属人性は、研究開発のスピードを落とすだけでなく、組織として知識やノウハウを蓄積していく上でも大きな障害となります。実験工程を自動化し、デジタル化されたワークフローに置き換えることで、次のような効果が得られます。
自動化がもたらす効果
- 実験の再現性向上
- 技術継承の容易化
- データ品質の均質化
- AI学習用データの継続的な蓄積
研究者は定型的な合成・評価作業から解放され、実験戦略の立案やデータの解釈といった、より付加価値の高い業務に集中できるようになります。
AIモデルの性能を最終的に支えるのは、高品質な実験データです。その意味において自動合成は、AI創薬を加速させる要素技術だといえます。
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創薬研究全体に広がる自動化の波
こうした動きは Orbis Medicines に限った話ではありません。近年、次のようなグローバルプレイヤーが、自動化ラボとAIを統合した研究基盤の構築を加速させています。
- Recursion(米国)
- Insilico Medicine(香港/米国)
- XtalPi(中国/米国)
大手製薬企業においても、自動合成設備やハイスループット評価系への投資は加速しており、創薬研究のデジタルトランスフォーメーション(DX)は今後さらに進展していくと考えられます。
AI×自動実験プラットフォームは、これまでの研究開発のあり方そのものを変える新たなインフラになろうとしています。
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当社が提供する海外CROの自動合成サービス
株式会社アクセラレート・バイオでは、こうした世界的な研究開発トレンドを踏まえ、海外CROとのネットワークを活用した自動合成サービスの紹介・導入支援を行っています。
近年、多くの海外CROでは、次のような先進的なサービスを展開しています。
- 自動化合成設備によるハイスループット合成
- ハイスループットケミストリーによる大規模スクリーニング
- Design-Make-Test-Analyze(DMTA)サイクルの統合運用
- AI支援によるライブラリー設計
国内だけではアクセスが難しい、こうした最先端の実験自動化環境を活用することで、次のような効果が期待できます。
海外CRO活用によって得られる価値
- 創薬プロジェクトの高速化
- ヒット探索効率の向上
- 社内合成リソース不足の解消
- 属人化した実験業務からの解放
- AI学習に活用できるデータ取得量の拡大
AI創薬が次のステージへ進む中で本当に重要なのは、AIツールを導入することそのものではなく、AIと実験を一体化した研究開発体制をいかに構築するかという点にあります。Orbis Medicines の事例は、その方向性を示す象徴的なケースといえるでしょう。
これからの創薬競争では、優れたAIモデルを持つ企業以上に、「AIが学習し続けられる実験基盤」を持つ企業が、大きな優位性を獲得していくと考えられます。
ABOUT US
当社の強み:AI × 物理シミュレーション × 自動化実験による次世代創薬支援
AI・量子計算・分子動力学・自動化実験を統合した、次世代の創薬プラットフォーム。
株式会社アクセラレート・バイオは、AI・量子計算・分子動力学、さらに自動化合成プラットフォームを融合したアプローチにより、創薬研究の効率化と高精度化を実現しております。低分子創薬の探索段階からリード最適化、さらに合成検討・条件最適化に至るまで、一貫した技術支援をご提供しております。
AI
生成AI・機械学習による分子設計と予測
物理シミュレーション
量子計算・分子動力学による高精度解析
自動化実験
自動合成プラットフォームによる高速検証
提供サービス
サービス 01
AIと物理シミュレーションを融合した動的構造解析
分子動力学シミュレーションとAIの融合により、標的タンパク質の動的挙動を可視化・解析いたします。静的構造では捉えられない結合部位の変動を捉え、より現実に近い創薬デザインを可能にします。
サービス 02
量子AI創薬プラットフォーム
量子計算とAIを組み合わせ、従来手法では捉えきれなかった分子特性を高精度に予測いたします。エネルギー計算・電子状態解析に基づく次世代の分子スクリーニングを実現します。
サービス 03
ターゲットベースの分子設計
標的タンパク質の構造情報に基づき、有望な候補化合物を効率的に設計いたします。結合親和性と選択性を両立させたde novoデザインをスピーディにご提供します。
サービス 04
リード化合物の最適化
活性・選択性・薬物動態を考慮した多面的な最適化を高速に実現。ADMET予測と組み合わせ、開発候補化合物へのスムーズな展開を支援します。
サービス 05
AI逆合成解析・自動合成最適化
目的化合物の合成手順をAIが逆算し、自動化合成プラットフォームによる実験でコスト・収率・反応条件を最適化いたします。設計から検証・合成まで、ワンストップで対応いたします。
探索から合成までの一貫支援フロー
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当社は、海外の先端AI創薬技術と国内の研究開発ニーズをつなぐ架け橋として、国内外の企業・研究機関との連携を通じ、新薬研究開発現場における課題解決と新たな価値創出に貢献してまいります。
| 会社名 | 株式会社アクセラレート・バイオ(Accelerate Bio Co., Ltd.) |
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| Webサイト | https://accelerate-bio.co.jp/ |


