BD Rhapsody™ システムとCurio Trekkerを用いた空間遺伝子解析 ～ Slide-tags 技術による真の空間シングルセルトランスクリプトーム解析 ～

本セミナーでは、近年注目されている空間トランスクリプトーム解析の一つの手法である Slide-Tags技術とBD Rhapsody™ シングルセル解析システムを組み合わせた、真の空間シングルセルトランスクリプトーム解析についてご紹介いたします。

Slide-Tags技術は切片の位置情報を含むDNAオリゴを切片中の核内にまでに浸透させ、その後完全な核を回収して、BD Rhapsody™ システムなどのシングルセル解析装置でsnRNA-seqが行えます。核を解析することでセルセグメンテーションが不要になり、核当たりの平均検出遺伝子数も従来のsnRNA-seqと同様に数千遺伝子が検出できるため、現在の空間トランスクリプトームの解析精度を向上できるとものと期待されております。

また、本技術はsnATAC-seqへの対応も予定されており、空間シングルセルマルチオミックス解析への扉を開く技術としても注目されております。